تؤمن الهيئة باحتياج العمل الجمركي الى التوفيق ما بين التسهيل والالتزام ، وتسعى بشكل مستمر لتحقيق التوازن بين الجانبين في تنفيذ كافة العمليات الجمركية وتقديم التسهيلات الجمركية المناسبة للقطاعات الاقتصادية المرتبطة بسلسلة التزويد في التجارة الدولية .
ومن خلال هذه الإجراءات تحاول الهيئة تقديم التسهيلات المتاحة لسرعة ادخال البيانات الجمركية والعمل عليها والافراج عن محتوياتها بأسرع شكل ممكن ، بما يساهم في تعزيز وتوطيد الشراكة والتواصل بين الهيئة العامة للجمارك والقطاعين العام والخاص ، وتوفير الاليات المناسبة لتفعيل اليات حماية حقوق الملكية الفكرية وما يتعلق بها من حقوق لأطراف العملية التجارية بشكل عام وبما يتماشى مع معايير منظمة الجمارك العالمية .